Особняк по ул. Большая Морская, 47 ведет свою историю с первой половины XVIII века. Свой современный вид с фасадом в стиле модерн он приобрел благодаря семье Набоковых, владевших домом с 1897 года и проживавших в нем до Октябрьской революции. В 1998 году, накануне столетия писателя, в его доме был официально открыт музей. В 2008 году он вошел в структуру СПбГУ.

Музей В. В. Набокова располагается на первом этаже особняка, где частично сохранены интерьеры столовой, библиотеки и Зеленой гостиной. Основу фонда музея составляют первые издания произведений Набокова, его фотографии, коллекция бабочек, собранных Набоковым в американский период, предметы быта и личные вещи членов семьи, среди которых книги из библиотеки В. Д. Набокова, картины Е. И. Набоковой, сачок, пенсне и карандаши В. В. Набокова.